Plateforme PPM-FPP
Protéomique Fonctionnelle
Le Pôle Protéome de Montpellier (PPM) est l’une des plateformes en sciences du vivant de l’Unité d’Appui à la Recherche BioCampus Montpellier. Le PPM fédère 4 sites de compétences en analyse protéomique, dont le site FPP de Protéomique Fonctionnelle qui est hébergé à l’Institut de Génomique Fonctionnelle.
Le PPM est l’un des 6 nœuds de l’infrastructure nationale en protéomique ProFi. Il est labellisé IBiSA depuis 2009 et certifié ISO 9001:2015 depuis 2015.
Le site FPP de protéomique fonctionnelle du PPM propose une double expertise et des technologies de pointe en :
• Spectrométrie de masse à haute résolution dédiée à l’identification et la quantification de protéines, à l’analyse différentielle (avec ou sans marquage) ou encore à la recherche de partenaires protéiques.
• Protéomique structurale pour l’étude des interactions protéines-protéines et ligands protéines ainsi que leur dynamique structurale dans des conditions natives.
Expertises et services
• Préparation d’échantillons biologiques (purification, séparation, enrichissement et préfractionnement) pour les analyses de spectrométrie de masse,
• Protéomique quantitative ciblée et à large échelle,
• Analyse structurale par spectrométrie de masse,
• Etude des modifications post-traductionnelles,
• Etudes interactomiques basées sur la spectrométrie de masse,
• Découverte et validation de biomarqueurs basées sur la spectrométrie de masse,
• Analyse bioinformatique et statistique des données produites.
Prise de contact
Pour toute demande de prestation de service ou de collaboration scientifique, veuillez prendre contact avec la plateforme en décrivant succinctement votre demande.
Une réunion en présence du personnel de la plateforme vous sera proposée dans les meilleurs délais pour échanger sur la faisabilité de votre projet, les stratégies et techniques à utiliser et la nature des services que la plateforme peut vous offrir. Lors de cet échange, le financement et le type de projet (prestation ou collaboration) seront également définis selon les termes de la charte du PPM. Le délai nécessaire à la réalisation des projets varie selon le type de service sollicité.
Source d’ionisation NanoSpray (Thermo Fisher Scientific)
IGF Sud 025
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IGF Sud 029 04 34 35 92 17
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IGF Nord 207c 04 34 35 92 64
IGF Sud 029 04 34 35 92 17Publications majeures
- Picard MAL, Leblay F, Cassan C, Willemsen A, Daron J, Bauffe F, Decourcelle M, Demange A, Bravo IG. Transcriptomic, proteomic and functional consequences of codon usage bias in human cells during heterologous gene expression. Protein Sci. 2023 Mar;32(3):e4576. doi: 10.1002/pro.4576. PMID: 36692287
- Rebendenne A, Roy P, Bonaventure B, Chaves Valadão AL, Desmarets L, Arnaud-Arnould M, Rouillé Y, Tauziet M, Giovannini D, Touhami J, Lee Y, DeWeirdt P, Hegde M, Urbach S, Koulali KE, de Gracia FG, McKellar J, Dubuisson J, Wencker M, Belouzard S, Moncorgé O, Doench JG, Goujon C. Bidirectional genome-wide CRISPR screens reveal host factors regulating SARS-CoV-2, MERS-CoV and seasonal HCoVs. Nat Genet. 2022 Aug;54(8):1090-1102. doi: 10.1038/s41588-022-01110-2. Epub 2022 Jul 25. PMID: 35879413
- Lambey P, Otun O, Cong X, Hoh F, Brunel L, Verdié P, Grison CM, Peysson F, Jeannot S, Durroux T, Bechara C, Granier S, Leyrat C. Structural insights into recognition of chemokine receptors by Staphylococcus aureus leukotoxins. 2022 Mar 21;11:e72555. doi: 10.7554/eLife.72555. PMID: 35311641
- Al Awabdh S, Donneger F, Goutierre M, Séveno M, Vigy O, Weinzettl P, Russeau M, Moutkine I, Lévi S, Marin P, Poncer JC. Gephyrin interacts with the K-Cl co-transporter KCC2 to regulate its surface expression and function in cortical neurons. J Neurosci. 2022 Jan 12;42(2):166-182. doi: 10.1523/JNEUROSCI.2926-20.2021. Epub 2021 Nov 22. PMID: 34810232
- Fumagalli A, Heuninck J, Pizzoccaro A, Moutin E, Koenen J, Séveno M, Durroux T, Junier MP, Schlecht-Louf G, Bachelerie F, Schütz D, Stumm R, Smit MJ, Guérineau NC, Chaumont-Dubel S, Marin P. The atypical chemokine receptor 3 interacts with Connexin 43 inhibiting astrocytic gap junctional intercellular communication. Nat Commun. 2020 Sep 25;11(1):4855. doi: 10.1038/s41467-020-18634-y. PMID: 32978390
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